Le musée est composé d’un jardin, d’une cour et de trois salles couvertes.
Le jardin conserve des chapiteaux, colonnes, stèles votives ou funéraires, et inscriptions diverses.
Dans la cour sont exposées des mosaïques et des sculptures, dont les têtes de Septime Sévère et de Julia Domna.
Les salles présentent aux murs et au sol d’immenses mosaïques qui ornaient les demeures et les édifices de Cuicul : la toilette de Vénus, l’âne vainqueur, l’Enlèvement d’Europe par Jupiter métamorphosé en taureau, des scènes de culte de Dionysos, un bestaire, l’enlèvement d’Hylas par les nymphes, la scène de la grande chasse.
